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3 Stellenangebote zu
Bioinformatik Informatik Studien- und Abschlussarbeiten Mecklenburg-Vorpommern

  • Master thesis in applied/microbial bioinformatics

    16.11.2018 Leibniz-Institut für Ostseeforschung Warnemünde (IOW) Rostock/Warnemünde
  • LITERATUR-/BACHELOR-/MASTERARBEIT ODER SOFTWAREPROJEKT IM BEREICH AUGMENTED REALITY (AR) UNTER WASSER

    05.02.2021 Fraunhofer-Institut für Graphische Datenverarbeitung Rostock Rostock
  • Literatur-/Masterarbeit im Bereich Bildverarbeitung oder Machine Learning

    21.01.2021 Fraunhofer-Institut für Graphische Datenverarbeitung Rostock Rostock
  • Bachelorarbeit zum Thema Export SCORM-konformer E-Learningmodule mit VR-Inhalten

    31.07.2020 Fraunhofer-Institut für Graphische Datenverarbeitung Rostock Rostock
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Master thesis in applied/microbial bioinformatics

Veröffentlicht am
16.11.2018
Vollzeit-Stelle
Leibniz-Institut für Ostseeforschung Warnemünde (IOW)
Zum Arbeitgeberprofil
Rostock/Warnemünde
logo

The Leibniz Institute for Baltic Sea Reasarch (IOW) offers a master thesis in the field of

bioinformatics with the topic

Master thesis in applied/microbial bioinformatics

in Rostock/Warnemünde

In the central Black Sea there is a encompassing suboxic to sulfidic waters. An initial analysis revealed that the microbial communities are strongly stratified along the redox gradient and dominated by particular bacterial and archaeal groups. These groups are involved in different microbial processes, such as nitrification, denitrification, Annamox and sulfur oxidation.

 

The focus of this master thesis lies in the metagenomics analysis of the different layers of the Black Sea redoxcline. A key aspect of this project is the identification and characterization of the microbial key players, in particular the metabolic reconstruction of the specific pathways.

 

Skills

 

  • experience in applied/microbial bioinformatics
  • experience in programming (preferably Python and/or R) and Unix
  • experience in version control (Git)
  • experience in containerization (e.g. Singularity or Docker) or conda desired
  • experience in workflow frameworks (e.g. Snakemake or NextFlow) desired

Contact

 

Please send your application (or questions) to johannes.werner@io-warnemuende.de.

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