Im Sonderforschungsbereich (SFB) „Dynamische Hydrogele an Biogrenzflächen“ untersuchen Wissenschaftler/-innen, welche physikalisch-chemischen Parameter den Oberflächen der Atemwege und des Darms deren schützende Funktion verleihen, welche Anomalien zu Erkrankungen führen und wie diese Erkenntnisse für die Entwicklung neuer therapeutischer Strategien bei Lungen- und Magen-Darm-Erkrankungen genutzt werden können.
Da die beteiligten interdisziplinären Forschungsgruppen verschiedensten Einrichtungen und Fachbereichen angehören, ist ein gemeinsamer Zugang zu den generierten heterogenen und zum Teil sehr großen Forschungsdaten (Bild- und Omics-Daten) für den Erfolg des SFB essentiell. In einem speziellen Teilprojekt wird daher untersucht, wie die für Datenhaltung, Datenaustausch und Datenverarbeitung notwendige Basis optimal zur Verfügung gestellt werden kann. Dies umfasst die gesamte Verarbeitungspipeline der Daten, von der schnellen Rohdatensicherung inklusive der Metadatenanreicherung über die partnerübergreifende Verarbeitung und Analyse bis hin zur Archivdatenhaltung.
Aufgabengebiet:
Die/Der Bewerber/-in soll als „Data Scientist“ eng mit den im SFB forschenden Wissenschaftler/-innen zusammenarbeiten. Das umfasst zum einen die gemeinsame Erstellung der für Datenhaltung, -austausch und -analyse notwendigen Strukturen und Arbeitsabläufe sowie die Definition prozessbezogener Metadaten, zum anderen die Einweisung der Wissenschaftler/-innen in die erarbeiteten Speicherkonzepte und die Nutzung der vorhandenen Speicherinfrastruktur. Wichtige Aspekte sind dabei u. a. Konzepte zur Verwaltung von Zugriffsrechten, zum Datenaustausch über einen gemeinsamen SharePoint, zu Verbindungen zu High Performance Computing (HPC)-Ressourcen, zur Anreicherung der Daten mit Metadaten sowie zur Langzeitarchivierung. Das perspektivische Ziel soll sein, die gemeinsame Bearbeitung der Daten innerhalb des SFB zu ermöglichen und die Zugänglichkeit der Daten über die Förderung des SFB hinaus durch Hinterlegung in geeigneten Repositorien zu gewährleisten.
Einstellungsvoraussetzungen:
Masterabschluss (oder vergleichbar) in einem MINT Fach, bevorzugt Informatik
(Berufs-)Erfahrung:
3 Jahre Berufserfahrung in der IT-Systemarchitektur und -administration
Erwünscht:
- hervorragende Kenntnisse und Fähigkeiten in der Systemintegration, -architektur, -automatisierung, Systemprogrammierung, wenigstens 2 Scriptsprachen
- Erfahrung bei der Leitung von IT-Projekten, bevorzugt im wiss. Bereich oder in der Leitung von kleinen IT-Teams
- Interesse an naturwissenschaftlichen Messverfahren wie Mikroskopie, Spektroskopie etc.
- hohe Motivation, Selbstständigkeit, Teamfähigkeit, Kommunikationsfähigkeit, Bereitschaft zu interdisziplinärer Zusammenarbeit
- Programmierkenntnisse
- sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Weitere Informationen erteilt Herr Prof. Dr. Christof Schütte (christof.schuette@fu-berlin.de).
Bewerbungen sind mit aussagekräftigen Unterlagen bis zum
10.05.2021 unter Angabe der
Kennung im Format PDF (vorzugsweise als ein Dokument) elektronisch per E-Mail zu richten an z. Hd. Dorothé Auth:
auth@mi.fu-berlin.de.
Aus gegebenem Anlass und für die Zeit des Präsenznotbetriebes der Freien Universität Berlin bitten wir Sie, sich elektronisch per E-Mail zu bewerben. Die Bearbeitung einer postalischen Bewerbung kann nicht sichergestellt werden.
Freie Universität Berlin
Fachbereich Mathematik und Informatik
Institut für Mathematik
Biocomputing / SFB 1449
z. Hd. Dorothé Auth
Arnimallee 6
14195 Berlin (Dahlem)
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Schwerbehinderte werden bei gleicher Qualifikation bevorzugt berücksichtigt. Die Freie Universität Berlin fordert Frauen ausdrücklich zur Bewerbung auf. Bewerbungen von Menschen mit Migrationshintergrund, die die Einstellungsvoraussetzungen erfüllen, sind ausdrücklich erwünscht. Vorstellungskosten können von der Freien Universität Berlin leider nicht übernommen werden. Bewerbungsunterlagen werden nicht zurückgesandt. Bitte reichen Sie Ihre Unterlagen nur in Kopie ein.