Thema: „Metabolic Profiling by Ion Mobility Mass Spectrometry: Differenzierung von Schalenfrüchten unter Schimmelbefall“
Startzeitpunkt: Zum nächst möglichen Zeitpunkt
Befristung: 6 Monate
Hintergrund:
An der HAMBURG SCHOOL OF FOOD SCIENCE (HSFS) werden verschiedene Ansätze der Metabolomics-Forschung verfolgt. Neben der geographischen Herkunftsbestimmung steht auch die Untersuchung von Lagerprozessen im Fokus.
Dabei sollen u. a. LC/MS-Methoden zur Charakterisierung des Metaboloms von Walnüssen sowie Mandeln entwickelt werden. Ziel ist dabei deren Analyse in Hinblick auf die Veränderung des Metaboloms unter Schimmelbefall. Relevante Biomarker werden zunächst mittels einer non-targeted-Methode (UHPLC-ESI-IM-QToF) identifiziert und anschließend in einer targeted-Methode (LC-MS/MS) quantifiziert.
Aufgaben:
Ziel der ausgeschriebenen Masterarbeit ist die Anwendung der Ionen-Mobilitäts-Massenspektrometrie (engl. ion mobility mass spectrometry, IM-MS) im Metabolomics-Bereich. In vorangegangenen Arbeiten wurden bereits non-targeted Methoden entwickelt, die auf diese spezielle analytische Fragestellung übertragen werden sollen. So soll letztlich die Metabolomveränderung während des Schimmelbefalls mit unterschiedlichen Kulturen vergleichend analysiert werden. Als Matrix dienen hierbei sowohl Walnüsse als auch Mandeln.
Durch die flüssigchromatographische Trennung und die anschließenden MS- sowie IMS-basierte Analyse können dabei vierdimensionale Datensätze erfasst werden. Diese werden mittels multivariater Datenanalyse (z. B. PCA) ausgewertet. Somit sind theoretische sowie praktische Grundkenntnisse im Bereich der Massenspektrometrie und der multivariaten Datenauswertung wünschenswert.